Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn8B1ARD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfn8B1ARD8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfn8B1ARD8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slfn8B1ARD8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slfn8B1ARD8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slfn8B1ARD8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slfn8B1ARD8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slfn8B1ARD8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slfn8B1ARD8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slfn8B1ARD8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slfn8B1ARD8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn8B1ARD8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn8B1ARD8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slfn8B1ARD8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms