Protein–RNA interactions for Protein: A2BDP1

Fam155b, Transmembrane protein FAM155B, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam155bA2BDP1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam155bA2BDP1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam155bA2BDP1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam155bA2BDP1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam155bA2BDP1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam155bA2BDP1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam155bA2BDP1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam155bA2BDP1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam155bA2BDP1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam155bA2BDP1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam155bA2BDP1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Fam155bA2BDP1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam155bA2BDP1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam155bA2BDP1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam155bA2BDP1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam155bA2BDP1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam155bA2BDP1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam155bA2BDP1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam155bA2BDP1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam155bA2BDP1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam155bA2BDP1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam155bA2BDP1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam155bA2BDP1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam155bA2BDP1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam155bA2BDP1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam155bA2BDP1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam155bA2BDP1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam155bA2BDP1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam155bA2BDP1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam155bA2BDP1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam155bA2BDP1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam155bA2BDP1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam155bA2BDP1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam155bA2BDP1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam155bA2BDP1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam155bA2BDP1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam155bA2BDP1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam155bA2BDP1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam155bA2BDP1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam155bA2BDP1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam155bA2BDP1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam155bA2BDP1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam155bA2BDP1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam155bA2BDP1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms