Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc183A2AJB1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc183A2AJB1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc183A2AJB1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms