Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pramel3A2AHA7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pramel3A2AHA7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pramel3A2AHA7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pramel3A2AHA7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pramel3A2AHA7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pramel3A2AHA7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pramel3A2AHA7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pramel3A2AHA7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pramel3A2AHA7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pramel3A2AHA7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pramel3A2AHA7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pramel3A2AHA7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pramel3A2AHA7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pramel3A2AHA7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pramel3A2AHA7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pramel3A2AHA7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pramel3A2AHA7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pramel3A2AHA7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pramel3A2AHA7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pramel3A2AHA7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pramel3A2AHA7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pramel3A2AHA7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pramel3A2AHA7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pramel3A2AHA7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pramel3A2AHA7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pramel3A2AHA7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pramel3A2AHA7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pramel3A2AHA7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pramel3A2AHA7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pramel3A2AHA7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pramel3A2AHA7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pramel3A2AHA7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pramel3A2AHA7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pramel3A2AHA7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pramel3A2AHA7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pramel3A2AHA7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pramel3A2AHA7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pramel3A2AHA7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pramel3A2AHA7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pramel3A2AHA7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pramel3A2AHA7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pramel3A2AHA7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pramel3A2AHA7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pramel3A2AHA7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pramel3A2AHA7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pramel3A2AHA7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pramel3A2AHA7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pramel3A2AHA7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pramel3A2AHA7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pramel3A2AHA7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pramel3A2AHA7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pramel3A2AHA7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pramel3A2AHA7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pramel3A2AHA7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pramel3A2AHA7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pramel3A2AHA7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pramel3A2AHA7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pramel3A2AHA7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pramel3A2AHA7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pramel3A2AHA7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pramel3A2AHA7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.4 ms