Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdc27A2A6Q5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdc27A2A6Q5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdc27A2A6Q5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cdc27A2A6Q5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc27A2A6Q5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc27A2A6Q5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc27A2A6Q5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc27A2A6Q5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc27A2A6Q5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc27A2A6Q5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc27A2A6Q5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc27A2A6Q5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc27A2A6Q5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc27A2A6Q5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc27A2A6Q5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc27A2A6Q5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc27A2A6Q5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc27A2A6Q5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc27A2A6Q5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc27A2A6Q5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc27A2A6Q5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc27A2A6Q5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc27A2A6Q5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc27A2A6Q5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc27A2A6Q5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc27A2A6Q5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc27A2A6Q5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc27A2A6Q5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc27A2A6Q5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc27A2A6Q5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc27A2A6Q5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc27A2A6Q5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc27A2A6Q5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc27A2A6Q5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc27A2A6Q5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc27A2A6Q5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc27A2A6Q5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdc27A2A6Q5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdc27A2A6Q5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdc27A2A6Q5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdc27A2A6Q5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdc27A2A6Q5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdc27A2A6Q5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdc27A2A6Q5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdc27A2A6Q5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdc27A2A6Q5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdc27A2A6Q5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cdc27A2A6Q5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdc27A2A6Q5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdc27A2A6Q5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdc27A2A6Q5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdc27A2A6Q5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdc27A2A6Q5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdc27A2A6Q5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdc27A2A6Q5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdc27A2A6Q5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdc27A2A6Q5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdc27A2A6Q5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms