Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SUT5

4930563M21Rik, RIKEN cDNA 4930563M21 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930563M21RikA0A1L1SUT5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930563M21RikA0A1L1SUT5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms