Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms