Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trbv15A0A0A6YYE3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv15A0A0A6YYE3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trbv15A0A0A6YYE3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv15A0A0A6YYE3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv15A0A0A6YYE3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv15A0A0A6YYE3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv15A0A0A6YYE3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv15A0A0A6YYE3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv15A0A0A6YYE3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv15A0A0A6YYE3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv15A0A0A6YYE3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv15A0A0A6YYE3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv15A0A0A6YYE3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv15A0A0A6YYE3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv15A0A0A6YYE3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv15A0A0A6YYE3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv15A0A0A6YYE3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv15A0A0A6YYE3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
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