Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQQ0

Gm28557, Predicted gene 28557, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28557A0A087WQQ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28557A0A087WQQ0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28557A0A087WQQ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28557A0A087WQQ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28557A0A087WQQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28557A0A087WQQ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28557A0A087WQQ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28557A0A087WQQ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28557A0A087WQQ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28557A0A087WQQ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28557A0A087WQQ0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28557A0A087WQQ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28557A0A087WQQ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28557A0A087WQQ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28557A0A087WQQ0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28557A0A087WQQ0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28557A0A087WQQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28557A0A087WQQ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28557A0A087WQQ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28557A0A087WQQ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28557A0A087WQQ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28557A0A087WQQ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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