Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six6Q9QZ28 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms