Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms