Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smco4Q9JIS3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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