Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1ip1Q9CQ20 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms