Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snapc4Q8BP86 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc4Q8BP86 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snapc4Q8BP86 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snapc4Q8BP86 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms