Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot1Q6ZQ08 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms