Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx4Q6RUU0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms