Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms