Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smchd1Q6P5D8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smchd1Q6P5D8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Smchd1Q6P5D8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smchd1Q6P5D8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smchd1Q6P5D8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smchd1Q6P5D8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smchd1Q6P5D8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smchd1Q6P5D8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smchd1Q6P5D8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smchd1Q6P5D8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smchd1Q6P5D8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smchd1Q6P5D8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smchd1Q6P5D8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smchd1Q6P5D8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smchd1Q6P5D8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smchd1Q6P5D8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smchd1Q6P5D8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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