Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Knl1Q66JQ7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Knl1Q66JQ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms