Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd1Q61345 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxd1Q61345 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd1Q61345 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms