Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdc1Q5PSV9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms