Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam228bQ497Q6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms