Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prdm10Q3UTQ7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm10Q3UTQ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm10Q3UTQ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm10Q3UTQ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm10Q3UTQ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm10Q3UTQ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm10Q3UTQ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm10Q3UTQ7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm10Q3UTQ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm10Q3UTQ7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm10Q3UTQ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm10Q3UTQ7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms