Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc10Q3TLI0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms