Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms