Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cct3P80318 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cct3P80318 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cct3P80318 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cct3P80318 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cct3P80318 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cct3P80318 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cct3P80318 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms