Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms