Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb41P48193 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb41P48193 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb41P48193 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms