Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5cP41230 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm5cP41230 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm5cP41230 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms