Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga1P29974 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga1P29974 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms