Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms