Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox4i1P19783 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox4i1P19783 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms