Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms