Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01725 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01725 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01725 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01725 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01725 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01725 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01725 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01725 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01725 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01725 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01725 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01725 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01725 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01725 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01725 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01725 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01725 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01725 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01725 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01725 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01725 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01725 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01725 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms