Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efna3O08545 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efna3O08545 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms