Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem200cJ3QK46 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem200cJ3QK46 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms