Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rfx7F8VPJ6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rfx7F8VPJ6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rfx7F8VPJ6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms