Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trappc8E9PWG2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms