Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsperg2C6KI89 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms