Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col9a3A2ACT7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms