Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Col5a3Q9JLI2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms