Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms