Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smco4Q9JIS3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms