Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtofQ9ESF1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtofQ9ESF1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms