Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx12Q9ER00 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms