Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms