Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ophn1Q99J31 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ophn1Q99J31 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ophn1Q99J31 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ophn1Q99J31 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ophn1Q99J31 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ophn1Q99J31 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ophn1Q99J31 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ophn1Q99J31 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ophn1Q99J31 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ophn1Q99J31 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ophn1Q99J31 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ophn1Q99J31 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ophn1Q99J31 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ophn1Q99J31 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms