Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dkk4Q8VEJ3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Dkk4Q8VEJ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dkk4Q8VEJ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk4Q8VEJ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dkk4Q8VEJ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms