Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx4Q6RUU0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms