Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2surpQ6NV83 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms